1992~1999
Doanh nghiệp tư nhân cung ứng hàng xuất khẩu Minh Phú được thành lập với vốn điều lệ ban đầu là 120 triệu đồng với lĩnh vực kinh doanh là thu mua, chế biến thủy sản cung ứng cho các đơn vị trong nước xuất khẩu.
Được đổi tên thành Xí nghiệp chế biến thủy sản Minh Phú và tăng vốn điều lệ lên thành 5 tỷ đồng.
2000~2009
Tháng 12/2002, Quyết định giải thể Xí nghiệp chế biến thủy sản Minh Phú, thành lập Công ty xuất nhập khẩu thủy sản Minh Phú - TNHH với vốn điều lệ là 90 tỷ đồng.
Chuyển đổi từ mô hình TNHH sang mô hình công ty cổ phần. Ngày 27/12/2006,
Minh Phú chính thức được niêm yết tại Trung tâm giao dịch chứng khoán Hà Nội với 60.000.000 cổ phiếu theo mệnh giá 10.000 đồng/cổ phiếu.
Tháng 06/2008, Minh Phú góp vốn 20 triệu USD vào công ty Mseafood, chiếm 90% vốn điều lệ Mseafood.
Tháng 07/2008, thành lập công ty con Công ty TNHH một thành viên sản xuất chế phẩm sinh học Minh Phú với vốn điều lệ 4,5 tỷ đồng.
Tháng 08/2009, khởi công xây dựng nhà máy chế biến thủy sản Minh Phú - Hậu Giang với công suất 40.000 tấn thành phẩm/năm với vốn đầu tư 50 triệu USD.
2010~2019
Ngày 23/06/2010, Công ty đổi tên thành Công ty Cổ phần Tập Đoàn Thủy Sản Minh Phú.
Sau đó, thành lập liên tiếp 2 công ty con Công ty TNHH một thành viên nuôi tôm sinh thái Minh Phú với vốn điều lệ là 20 tỷ đồng và
Công ty TNHH nuôi trồng thủy sản Minh Phú - Lộc An với vốn điều lệ 50 tỷ đồng.
Năm 2013: Minh Phú Hậu Giang thực hiện tăng vốn thông qua bên thứ ba từ MPM Investments (công ty con của Mitsui)
Năm 2017: Minh Phú tham gia thành lập Công ty Cổ phần Xã hội Chuỗi tôm rừng Minh Phú, Cà Mau với vốn điều lệ là 18.000.000.000 VND
với mục đích là liên kết các hộ dân, nông lâm ngư trường nhằm nuôi tôm bền vững, đạt các chứng chỉ chứng nhận quốc tế và bảo vệ môi trường rừng.
Cũng trong năm này, Công ty chính thức giao dịch tại sàn Upcom vào ngày 16/10/2017.
Năm 2018: Công ty thành lập Công ty Cổ phần Nông nghiệp Công nghệ cao Minh Phú với vốn điều lệ 100 tỷ đồng, lĩnh vực kinh doanh chính là chế biến, bảo quản thủy sản và các sản phẩm
từ thủy sản.
Năm 2019: Công ty tăng vốn điều lệ từ 1.400 tỷ đồng lên 2.000 tỷ đồng thông qua thực hiện phát hành riêng lẻ cho MPM Investments (Công ty con của Mitsui).
Cũng trong năm này, Minh Phú ký kết với Tập đoàn FPT để thực hiện chuyển đổi số.
2020~
Tháng 07/2020: thành lập Công ty TNHH Xuất khẩu thủy sản Minh Phú, vốn điều lệ 2 tỷ đồng, thuộc sở hữu 100% công ty mẹ Minh Phú.
Tháng 10/2020: thành lập Công ty CP Công nghệ Otanics, vốn điều lệ 100 triệu đồng, công ty mẹ Minh Phú sở hữu 51%.
Tháng 11/2020, Công ty TNHH Sản xuất Giống Thủy sản Minh Phú tăng vốn điều lệ từ 88 tỷ lên 138 tỷ. Công ty Mẹ Minh Phú sở hữu 99,67%.
Tháng 10/2020: thành lập Công ty CP Công nghệ Otanics, vốn điều lệ 100 triệu đồng, công ty mẹ Minh Phú sở hữu 51%.
Tháng 11/2020, Công ty TNHH Sản xuất Giống Thủy sản Minh Phú tăng vốn điều lệ từ 88 tỷ lên 138 tỷ. Công ty Mẹ Minh Phú sở hữu 99,67%.
Tháng 02/2021, Công ty TNHH Thủy hải sản Minh Phú Kiên Giang tăng vốn điều lệ từ 820 tỷ
đồng lên 1.218,4 tỷ đồng. Nâng tỷ lệ sở hữu của Công ty Mẹ Minh Phú lên 100%.
Tháng 04/2021, Công ty TNHH Kho vận EBISUMO tăng vốn điều lệ từ 2 tỷ đồng lên 20 tỷ đồng, thuộc sở hữu 100% công ty mẹ Minh Phú.
Tháng 06/2021, Công ty TNHH Nông nghiệp Công nghệ cao Minh Phú tăng vốn điều lệ từ 609 tỷ đồng lên 669 tỷ đồng. Công ty Mẹ Minh Phú sở hữu 100%.
Tháng 10/2021, Khởi động chuỗi dự án Nhà máy chế biến thủy sản Minh Phú tại Khu công nghiệp Khánh An, xã Khánh An, huyện U Minh gồm có: Nhà máy chế biến thủy sản Minh Phú, với công suất thiết kế 19 ngàn tấn/năm, trên diện tích đất xây dựng hơn 29.800m2. Nhà máy chế biến thủy sản Minh Phát, với công suất thiết kế 19 ngàn tấn/năm, trên diện tích đất xây dựng hơn 29.800 m2. Mỗi dự án có tổng vốn đầu tư 500 tỷ đồng. Nhà máy xử lý nước thải tập trung, công suất thiết kế 2.700 m3/ngày đêm, trên diện tích đất xây dựng 2,73 ha, tổng vốn đầu tư 50 tỷ đồng.
Tháng 04/2021, Công ty TNHH Kho vận EBISUMO tăng vốn điều lệ từ 2 tỷ đồng lên 20 tỷ đồng, thuộc sở hữu 100% công ty mẹ Minh Phú.
Tháng 06/2021, Công ty TNHH Nông nghiệp Công nghệ cao Minh Phú tăng vốn điều lệ từ 609 tỷ đồng lên 669 tỷ đồng. Công ty Mẹ Minh Phú sở hữu 100%.
Tháng 10/2021, Khởi động chuỗi dự án Nhà máy chế biến thủy sản Minh Phú tại Khu công nghiệp Khánh An, xã Khánh An, huyện U Minh gồm có: Nhà máy chế biến thủy sản Minh Phú, với công suất thiết kế 19 ngàn tấn/năm, trên diện tích đất xây dựng hơn 29.800m2. Nhà máy chế biến thủy sản Minh Phát, với công suất thiết kế 19 ngàn tấn/năm, trên diện tích đất xây dựng hơn 29.800 m2. Mỗi dự án có tổng vốn đầu tư 500 tỷ đồng. Nhà máy xử lý nước thải tập trung, công suất thiết kế 2.700 m3/ngày đêm, trên diện tích đất xây dựng 2,73 ha, tổng vốn đầu tư 50 tỷ đồng.
Tháng 09/2022, Công ty phát hành thêm cổ phiếu với tỷ lệ 1:1 nâng tổng vốn điều lệ lên 3.998,873 tỷ đồng.
Tháng 11/2023, phê duyệt chủ trương dự án Đầu tư xây dựng Nhà ở xã hội ở xã Khánh An, huyện U Minh.